HLA и Covid-19

Генетические факторы, такие как HLA-тип пациентов, могут играть роль в отношении тяжести заболевания и клинических исходов пациентов с COVID-19. Взяв данные, депонированные в базе данных GISAID, E. de Sousa et al сделали прогнозы, используя ресурс анализа IEDB (TepiTool), чтобы оценить, как варианты в геноме SARS-CoV-2 могут изменять связывание пептида с наиболее частыми аллелями MHC-класса I и -II в Африке, Азии и Европе. E. de Sousa et al охарактеризовали, как одиночная мутация в последовательности SARS-CoV-2 может влиять на связывание пептида вариантов SARS-CoV-2 с MHC класса II, но не с аллелями MHC класса I. Предполагая, что мутация ORF8 (L84S) является биологически значимой, селективное давление со стороны аллелей MHC класса II может отбирать вирусные разновидности и впоследствии влиять на качество и количество клеточных иммунных ответов в отношении SARS-CoV-2. 4-значное типирование MHC вместе с анализом вирусной последовательности следует рассматривать в исследованиях, изучающих клинические исходы у пациентов с COVID-19

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1201971220305609